JAVAのフレームワークのSpring Frameworkで開発する際、公式で配布されている開発ツールのSpring Tool Suite（STS）を使用するかと思います。Spring Bootで開発する際のportの変更方法は公式にもあるのですが、Spring Legacy Project（STSでプロジェクト作成時の名称）をtc Server（標準で左下にあるServersウィンドウ）に登録して動かした場合のportの変更方法が調べても見つからず、しばらく時間を使ってしまったので備忘録として記載します。
修正する場所
workspace（STS初回起動時に設定した、プロジェクトの配置場所）に、Serversというディレクトリができていると思います。tc Serverはこのディレクトリ以下のプロジェクトで動いているため、この中のPivotal tc Server Developer Edition vX.X-config（X.Xはバージョン）の中のcatalina.propertiesをテキストエディタ（もしくはSTS）で開いてください。一番下にbio.http.portがあるかと思います。そこを修正すればportが変わります。
ハマった部分
・STSがあるディレクトリのpivotal-tc-server-developerを修正していた
STSにはTomcatが内包されており、pivotal-tc-server-developerはSpringで作成したWEBアプリケーションを実行するためのサーバープログラムが入っています。上記ディレクトリの中にあるbase-instans内にconfがあり、その中にもcatalina.propertiesがあります。ただ、ここを変更しても反映されず、更にファイルごと上書きされてしまいます。
・application.propertiesに記載した
「Spring port 変更」等で調べると、ほとんどで「application.propertiesに記載する」と出てくるのですが、こちらはSpring Bootで作成した、WEBアプリケーションのportを変更する際に設定するものです。
ちなみに、application.propertiesはSTSで「Spring Starter Project」でプロジェクトを作成すればsrc/main/resources以下に作成されますので、ファイル内に
server.port=ポート番号
を記載すれば指定したポート番号でアクセスできるようになります。
以上、ほとんど参考にすることはないかもしれませんが、同じ問題で悩んでおられるようであればお試しください。